Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG3O60359 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG3O60359 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG3O60359 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG3O60359 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG3O60359 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG3O60359 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG3O60359 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG3O60359 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNG3O60359 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNG3O60359 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNG3O60359 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNG3O60359 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNG3O60359 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNG3O60359 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms