Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAK2O60296 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAK2O60296 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms