Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYNGR2O43760 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR2O43760 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms