Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYTH3O43739 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CYTH3O43739 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms