Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DENRO43583 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENRO43583 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENRO43583 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENRO43583 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENRO43583 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENRO43583 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DENRO43583 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DENRO43583 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DENRO43583 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DENRO43583 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DENRO43583 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms