Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP8B1O43520 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms