Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SYNJ1O43426 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SYNJ1O43426 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms