Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCP110O43303 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCP110O43303 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCP110O43303 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCP110O43303 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCP110O43303 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCP110O43303 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCP110O43303 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCP110O43303 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCP110O43303 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCP110O43303 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCP110O43303 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCP110O43303 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCP110O43303 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCP110O43303 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCP110O43303 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCP110O43303 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms