Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MAP3K13O43283 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAP3K13O43283 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms