Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 STK24-204ENST00000418038 2172 ntTSL 214.56□□□□□ -0.082e-6■■■■□ 21.6
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PRPF4O43172 AHSA1-204ENST00000554156 588 ntTSL 214.33□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 HDGF-207ENST00000477306 686 ntTSL 213.8□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 MAP4K5-203ENST00000554091 619 ntTSL 313.46□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 CDCA2-202ENST00000380665 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 NEURL4-210ENST00000573651 1850 ntTSL 513.15□□□□□ -0.32e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 POLE-222ENST00000545015 366 ntTSL 212.77□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 ZNF175-203ENST00000545217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 POLE-212ENST00000539215 483 ntTSL 511.93□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 AC069257.3-201ENST00000431391 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 NEURL4-209ENST00000573186 4431 ntTSL 511.44□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 STK24-202ENST00000376554 3602 ntTSL 511.16□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 21.6
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PRPF4O43172 SUPT16H-202ENST00000552829 669 ntTSL 210.72□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 21.6
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PRPF4O43172 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.782e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SEPT9-225ENST00000589250 527 ntTSL 29.07□□□□□ -0.962e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 ANKMY1-223ENST00000489677 292 ntTSL 57.65□□□□□ -1.182e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 TCTEX1D2-202ENST00000426563 603 ntTSL 27.4□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 AHSA1-212ENST00000556963 787 ntTSL 27.17□□□□□ -1.262e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 ANXA4-210ENST00000484219 338 ntTSL 55.2□□□□□ -1.582e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 SEPT11-212ENST00000512575 587 ntTSL 44.41□□□□□ -1.72e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 RBM6-208ENST00000438912 473 ntTSL 54.08□□□□□ -1.762e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 PMS1-216ENST00000447734 570 ntTSL 54□□□□□ -1.771e-17■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 MAP4K5-206ENST00000555216 592 ntTSL 43.82□□□□□ -1.82e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 DMTN-218ENST00000522148 616 ntTSL 522.37■■□□□ 1.171e-7■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 DMTN-211ENST00000518816 997 ntTSL 219.23■□□□□ 0.671e-7■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 DMTN-222ENST00000523623 581 ntTSL 316.83■□□□□ 0.281e-7■■■■□ 21.6
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PRPF4O43172 DMTN-221ENST00000523300 601 ntTSL 415.35■□□□□ 0.051e-7■■■■□ 21.6
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PRPF4O43172 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 21.6
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PRPF4O43172 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.911e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.941e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -11e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.041e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 56.41□□□□□ -1.381e-6■■■■□ 21.6
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PRPF4O43172 UBQLN4-203ENST00000472638 654 ntTSL 518.85■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 21.6
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PRPF4O43172 TCF25-204ENST00000561958 763 ntTSL 315.83■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.667e-9■■■■□ 21.6
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PRPF4O43172 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.075e-7■■■■□ 21.6
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PRPF4O43172 ZFPL1-208ENST00000526945 576 ntTSL 37.91□□□□□ -1.143e-6■■■■□ 21.6
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PRPF4O43172 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 21.6
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PRPF4O43172 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 AMFR-204ENST00000563664 567 ntTSL 49.42□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 21.6
PRPF4O43172 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.638e-8■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.428e-8■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 PHF1-211ENST00000495509 1752 ntTSL 215.45■□□□□ 0.068e-8■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 HERC2-207ENST00000564734 3121 ntTSL 1 (best)16.06■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.231e-6■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.46e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 TOLLIP-209ENST00000528719 669 ntTSL 423.55■■□□□ 1.366e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.36e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 ATP10A-206ENST00000555815 6766 ntTSL 521.66■■□□□ 1.066e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 ATP10A-202ENST00000389967 1186 ntTSL 1 (best)20.93■□□□□ 0.946e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 NCOR2-223ENST00000542565 746 ntTSL 319.42■□□□□ 0.76e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.76e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.586e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.456e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.426e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 PLEKHG2-208ENST00000478523 664 ntTSL 517.56■□□□□ 0.46e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 FAM60A-208ENST00000543615 669 ntTSL 517.29■□□□□ 0.366e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.286e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 XAB2-202ENST00000595288 4555 ntTSL 215.9■□□□□ 0.146e-7■■■■□ 21.5
PRPF4O43172 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.116e-7■■■■□ 21.5
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