Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPTLC1O15269 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC1O15269 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms