Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC27A2O14975 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC27A2O14975 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms