Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TXNDC9O14530 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TXNDC9O14530 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TXNDC9O14530 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms