Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 NEPRO-208ENST00000469809 1512 ntTSL 313.01□□□□□ -0.336e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.346e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 PSTPIP2-202ENST00000587042 859 ntTSL 212.89□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-201ENST00000293062 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.356e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-215ENST00000614135 2942 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.356e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-218ENST00000617966 2927 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.356e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-203ENST00000433821 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.356e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IFT22-211ENST00000621899 2272 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.356e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-217ENST00000486271 2842 ntTSL 212.84□□□□□ -0.356e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RIPOR1-202ENST00000379312 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.366e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 LHX6-203ENST00000373755 3384 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MTIF3-212ENST00000493719 760 ntTSL 512.68□□□□□ -0.386e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RIPOR1-205ENST00000540839 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.386e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 POGLUT1-201ENST00000295588 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IFT22-205ENST00000440362 1727 ntTSL 212.62□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.46e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 PSTPIP2-201ENST00000409746 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MTIF3-207ENST00000471771 877 ntTSL 512.52□□□□□ -0.416e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-207ENST00000587738 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.416e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IL18-206ENST00000534225 880 ntTSL 1 (best)12.42□□□□□ -0.426e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.434e-21■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 AP5S1-205ENST00000615891 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-22■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 LHX6-202ENST00000373754 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RIPOR1-201ENST00000042381 4051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.446e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.449e-24■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-205ENST00000586305 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.456e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.456e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IFT22-207ENST00000485695 923 ntTSL 512.18□□□□□ -0.466e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IFT22-204ENST00000437644 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.466e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.476e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IL18-201ENST00000280357 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.476e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-204ENST00000454404 3116 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.486e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 PSTPIP2-204ENST00000589328 2900 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.493e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.56e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-209ENST00000519286 965 ntTSL 511.88□□□□□ -0.516e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 OSBPL6-206ENST00000409045 3427 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.516e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-220ENST00000622174 2651 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.536e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-202ENST00000426920 2650 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.536e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-219ENST00000618320 3313 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.556e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-214ENST00000592322 3313 ntTSL 511.59□□□□□ -0.556e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 DDX31-205ENST00000438527 2814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 LHX6-206ENST00000482062 918 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 GMDS-AS1-214ENST00000534468 724 ntTSL 311.41□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-217ENST00000615439 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 EXTL2-202ENST00000370114 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.66e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-204ENST00000461381 1048 ntTSL 211.22□□□□□ -0.616e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-224ENST00000496340 520 ntTSL 411.22□□□□□ -0.616e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-221ENST00000494575 556 ntTSL 411.22□□□□□ -0.616e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MT1G-201ENST00000379811 405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.644e-21■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IFT22-202ENST00000422177 1785 ntTSL 510.88□□□□□ -0.676e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MTIF3-201ENST00000381116 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.676e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 OSBPL6-205ENST00000392505 3637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.696e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IFT22-209ENST00000498704 917 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.76e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MTIF3-204ENST00000460973 785 ntTSL 510.65□□□□□ -0.76e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 OFD1-209ENST00000490265 4259 ntTSL 210.61□□□□□ -0.716e-15■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-222ENST00000494891 547 ntTSL 410.5□□□□□ -0.736e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 OSBPL6-204ENST00000359685 7114 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.746e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MTIF3-205ENST00000461838 947 ntTSL 310.41□□□□□ -0.746e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-205ENST00000517392 2771 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.756e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-219ENST00000522490 861 ntTSL 310.25□□□□□ -0.776e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 RASGRP4-216ENST00000615340 4074 ntTSL 510.14□□□□□ -0.796e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-202ENST00000383675 4672 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.86e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ZFYVE16-205ENST00000509562 684 ntTSL 39.83□□□□□ -0.847e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IL18-202ENST00000524595 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.846e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 GMDS-AS1-213ENST00000534441 738 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MTIF3-210ENST00000485650 798 ntTSL 39.28□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-207ENST00000518853 813 ntTSL 38.98□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 POGLUT1-205ENST00000476573 567 ntTSL 48.97□□□□□ -0.972e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MTIF3-202ENST00000381120 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.986e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 AL109804.1-201ENST00000620777 562 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.992e-22■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-222ENST00000523209 866 ntTSL 58.88□□□□□ -0.996e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-223ENST00000496206 751 ntTSL 58.86□□□□□ -0.996e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MT1G-202ENST00000444837 406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.014e-21■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.036e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NEPRO-212ENST00000472705 1212 ntTSL 28.55□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.056e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 DYNLT3-202ENST00000378581 920 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.056e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.052e-14■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MTIF3-206ENST00000464753 296 ntTSL 28.37□□□□□ -1.076e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.096e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IFT22-208ENST00000495166 567 ntTSL 28.24□□□□□ -1.096e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.126e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IFT22-201ENST00000315322 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.156e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 SLF1-208ENST00000508383 328 ntTSL 37.26□□□□□ -1.256e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 SLF1-206ENST00000504099 578 ntTSL 47.26□□□□□ -1.256e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 EXTL2-203ENST00000416479 730 ntTSL 27.06□□□□□ -1.286e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.296e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-212ENST00000520761 865 ntTSL 56.84□□□□□ -1.316e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.336e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IL18-205ENST00000533858 758 ntTSL 36.61□□□□□ -1.356e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ZFYVE16-210ENST00000512442 688 ntTSL 26.43□□□□□ -1.386e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.387e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 EXTL2-205ENST00000480774 678 ntTSL 26.29□□□□□ -1.46e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ADSL-207ENST00000498234 323 ntTSL 26.17□□□□□ -1.426e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.466e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 ZFYVE16-211ENST00000512558 4496 ntTSL 25.71□□□□□ -1.57e-10■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.56e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 MTIF3-209ENST00000484342 373 ntTSL 55.62□□□□□ -1.516e-8■■■■■ 35.7
DDX3XO00571 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.556e-8■■■■■ 35.7
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