Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
EBAG9O00559 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
EBAG9O00559 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms