Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL9O00512 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL9O00512 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL9O00512 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCL9O00512 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BCL9O00512 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL9O00512 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL9O00512 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL9O00512 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL9O00512 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL9O00512 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL9O00512 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL9O00512 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL9O00512 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL9O00512 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCL9O00512 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL9O00512 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL9O00512 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL9O00512 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL9O00512 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL9O00512 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL9O00512 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL9O00512 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL9O00512 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL9O00512 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL9O00512 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL9O00512 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCL9O00512 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCL9O00512 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL9O00512 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL9O00512 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL9O00512 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL9O00512 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL9O00512 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BCL9O00512 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BCL9O00512 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL9O00512 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL9O00512 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL9O00512 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL9O00512 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL9O00512 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BCL9O00512 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BCL9O00512 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27■■□□□ 1.91
BCL9O00512 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms