Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AGRNO00468 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AGRNO00468 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRNO00468 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRNO00468 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRNO00468 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AGRNO00468 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AGRNO00468 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGRNO00468 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGRNO00468 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms