Protein–RNA interactions for Protein: O00463

TRAF5, TNF receptor-associated factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5O00463 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAF5O00463 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRAF5O00463 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms