Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DFFAO00273 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DFFAO00273 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DFFAO00273 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DFFAO00273 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DFFAO00273 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DFFAO00273 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms