Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARVCFO00192 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARVCFO00192 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms