Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms