Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CCDC179H3BU77 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CCDC179H3BU77 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms