Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BQV1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQV1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQV1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQV1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQV1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQV1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQV1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQV1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQV1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQV1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQV1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQV1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQV1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BQV1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BQV1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H3BQV1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H3BQV1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
H3BQV1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H3BQV1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms