Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GOLGA8SH3BPF8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA8SH3BPF8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms