Protein–RNA interactions for Protein: D6R901

USP17L21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L21D6R901 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L21D6R901 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L21D6R901 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms