Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPBD1B2RD01 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPBD1B2RD01 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPBD1B2RD01 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPBD1B2RD01 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPBD1B2RD01 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPBD1B2RD01 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPBD1B2RD01 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPBD1B2RD01 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPBD1B2RD01 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPBD1B2RD01 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CENPBD1B2RD01 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CENPBD1B2RD01 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms