Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCCD1A6NED2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RCCD1A6NED2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms