Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GOLGA6BA6NDN3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GOLGA6BA6NDN3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms