Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PALM3A6NDB9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PALM3A6NDB9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms