Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VWA3AA6NCI4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VWA3AA6NCI4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms