Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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