Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PIAS3Q9Y6X2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms