Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX9Q9Y5X1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX9Q9Y5X1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms