Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms