Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UTP11Q9Y3A2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UTP11Q9Y3A2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms