Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHDC2Q9Y2U9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLHDC2Q9Y2U9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms