Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SCN8AQ9UQD0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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