Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGAP1Q9UPQ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGAP1Q9UPQ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms