Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNW9

NOVA2, RNA-binding protein Nova-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOVA2Q9UNW9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NOVA2Q9UNW9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NOVA2Q9UNW9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms