Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PNMA8BQ9ULN7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNMA8BQ9ULN7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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