Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MED23Q9ULK4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MED23Q9ULK4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms