Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PADI1Q9ULC6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PADI1Q9ULC6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PADI1Q9ULC6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PADI1Q9ULC6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PADI1Q9ULC6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PADI1Q9ULC6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PADI1Q9ULC6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PADI1Q9ULC6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PADI1Q9ULC6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PADI1Q9ULC6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PADI1Q9ULC6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms