Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MRTO4Q9UKD2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MRTO4Q9UKD2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms