Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGA2Q9UJY4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGA2Q9UJY4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms