Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNTNAP2Q9UHC6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTNAP2Q9UHC6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms