Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IFT172Q9UG01 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
IFT172Q9UG01 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IFT172Q9UG01 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms