Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DBF4Q9UBU7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DBF4Q9UBU7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms