Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC6Q9UBN7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC6Q9UBN7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms