Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COL20A1Q9P218 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms