Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALCOCO1Q9P1Z2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CALCOCO1Q9P1Z2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms